Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8a1P70414 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms