Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

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Length 946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn1P70268 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn1P70268 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn1P70268 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn1P70268 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn1P70268 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn1P70268 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn1P70268 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkn1P70268 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkn1P70268 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkn1P70268 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Pkn1P70268 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms