Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NficP70255 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NficP70255 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms