Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf6P70196 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf6P70196 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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