Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms