Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms