Protein–RNA interactions for Protein: P61294

Rab6b, Ras-related protein Rab-6B, mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6bP61294 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab6bP61294 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms