Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms