Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AgrpP56473 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AgrpP56473 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms