Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms