Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux1P53564 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux1P53564 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux1P53564 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux1P53564 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms