Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Map3k1P53349 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms