Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms