Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms