Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms