Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Resp18P47939 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Resp18P47939 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Resp18P47939 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Resp18P47939 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms