Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms