Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms