Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1P40201 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd1P40201 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chd1P40201 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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