Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf1P39428 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf1P39428 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms