Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtlP38585 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtlP38585 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtlP38585 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtlP38585 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtlP38585 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtlP38585 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtlP38585 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtlP38585 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TtlP38585 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtlP38585 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtlP38585 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtlP38585 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtlP38585 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtlP38585 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtlP38585 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtlP38585 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtlP38585 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtlP38585 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtlP38585 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtlP38585 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms