Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2aP35436 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms