Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pola2P33611 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pola2P33611 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pola2P33611 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pola2P33611 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pola2P33611 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pola2P33611 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pola2P33611 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms