Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim2P33610 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms