Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprmP28828 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprmP28828 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprmP28828 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprmP28828 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprmP28828 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprmP28828 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprmP28828 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprmP28828 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprmP28828 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprmP28828 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprmP28828 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprmP28828 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprmP28828 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprmP28828 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprmP28828 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprmP28828 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprmP28828 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprmP28828 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprmP28828 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprmP28828 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprmP28828 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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