Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms