Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms