Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms