Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkchP23298 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkchP23298 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkchP23298 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkchP23298 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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