Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RarbP22605 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RarbP22605 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RarbP22605 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RarbP22605 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RarbP22605 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RarbP22605 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RarbP22605 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RarbP22605 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RarbP22605 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RarbP22605 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RarbP22605 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RarbP22605 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RarbP22605 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RarbP22605 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RarbP22605 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RarbP22605 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RarbP22605 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RarbP22605 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RarbP22605 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RarbP22605 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RarbP22605 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RarbP22605 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RarbP22605 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RarbP22605 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RarbP22605 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RarbP22605 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RarbP22605 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RarbP22605 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RarbP22605 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RarbP22605 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RarbP22605 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RarbP22605 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RarbP22605 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RarbP22605 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RarbP22605 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RarbP22605 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RarbP22605 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RarbP22605 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RarbP22605 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RarbP22605 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RarbP22605 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RarbP22605 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RarbP22605 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RarbP22605 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
RarbP22605 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RarbP22605 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RarbP22605 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RarbP22605 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RarbP22605 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RarbP22605 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RarbP22605 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RarbP22605 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RarbP22605 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RarbP22605 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RarbP22605 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RarbP22605 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RarbP22605 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RarbP22605 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms