Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms