Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms