Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VimP20152 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VimP20152 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VimP20152 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VimP20152 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VimP20152 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VimP20152 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VimP20152 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VimP20152 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VimP20152 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VimP20152 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VimP20152 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VimP20152 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VimP20152 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VimP20152 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VimP20152 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VimP20152 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VimP20152 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VimP20152 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VimP20152 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VimP20152 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VimP20152 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VimP20152 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VimP20152 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VimP20152 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VimP20152 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VimP20152 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VimP20152 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VimP20152 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VimP20152 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VimP20152 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VimP20152 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VimP20152 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
VimP20152 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms