Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms