Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RargP18911 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RargP18911 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RargP18911 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RargP18911 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RargP18911 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RargP18911 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RargP18911 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RargP18911 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RargP18911 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RargP18911 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RargP18911 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RargP18911 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RargP18911 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RargP18911 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RargP18911 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RargP18911 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RargP18911 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RargP18911 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RargP18911 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RargP18911 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RargP18911 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RargP18911 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RargP18911 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RargP18911 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RargP18911 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RargP18911 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RargP18911 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RargP18911 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RargP18911 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RargP18911 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms