Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhoP15409 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhoP15409 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhoP15409 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhoP15409 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RhoP15409 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhoP15409 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhoP15409 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhoP15409 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RhoP15409 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhoP15409 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RhoP15409 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RhoP15409 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhoP15409 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhoP15409 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RhoP15409 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhoP15409 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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