Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb1P12658 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb1P12658 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms