Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Egr1P08046 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Egr1P08046 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Egr1P08046 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms