Protein–RNA interactions for Protein: P07607

Tyms, Thymidylate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TymsP07607 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TymsP07607 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TymsP07607 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TymsP07607 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TymsP07607 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TymsP07607 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TymsP07607 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TymsP07607 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TymsP07607 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TymsP07607 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms