Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms