Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01740 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01740 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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