Protein–RNA interactions for Protein: P01671

Ig kappa chain V-III region PC 7175, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01671 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01671 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01671 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01671 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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