Protein–RNA interactions for Protein: P01670

Ig kappa chain V-III region PC 6684, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01670 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01670 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01670 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01670 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms