Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sp1O89090 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms