Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcn2O88703 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcn2O88703 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcn2O88703 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcn2O88703 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hcn2O88703 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcn2O88703 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcn2O88703 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcn2O88703 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcn2O88703 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hcn2O88703 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcn2O88703 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcn2O88703 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcn2O88703 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hcn2O88703 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hcn2O88703 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcn2O88703 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcn2O88703 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcn2O88703 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcn2O88703 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hcn2O88703 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hcn2O88703 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcn2O88703 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcn2O88703 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcn2O88703 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hcn2O88703 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Hcn2O88703 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hcn2O88703 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hcn2O88703 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hcn2O88703 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hcn2O88703 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hcn2O88703 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hcn2O88703 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms