Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BlmO88700 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BlmO88700 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BlmO88700 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BlmO88700 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BlmO88700 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BlmO88700 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BlmO88700 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BlmO88700 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BlmO88700 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BlmO88700 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BlmO88700 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BlmO88700 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BlmO88700 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BlmO88700 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BlmO88700 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BlmO88700 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BlmO88700 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BlmO88700 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BlmO88700 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BlmO88700 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
BlmO88700 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BlmO88700 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BlmO88700 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BlmO88700 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BlmO88700 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BlmO88700 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BlmO88700 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BlmO88700 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BlmO88700 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BlmO88700 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BlmO88700 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BlmO88700 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BlmO88700 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BlmO88700 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BlmO88700 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms