Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfdp1O88271 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms