Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms