Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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