Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copb2O55029 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copb2O55029 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copb2O55029 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copb2O55029 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copb2O55029 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copb2O55029 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms